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樣品的處理包括稱量、溶解到標(biāo)記稀釋等步驟。樣品處理要盡量減少操作者的技術(shù)問題帶來的誤差，樣品的稀釋次數(shù)、稀釋工具都是誤差的來源

在分析中因輸液泵的故障而引起分析結(jié)果的不準(zhǔn)確是很常見。如塵埃、垃圾等污染物進(jìn)入輸液流道內(nèi)，引起配管堵塞，單向閥污染引起壓力不穩(wěn)，密封墊損壞導(dǎo)致系統(tǒng)漏液，柱塞桿損壞引起無流動(dòng)相流出，壓力波動(dòng)。保證輸液泵的穩(wěn)定和正常運(yùn)行對(duì)分析結(jié)果的準(zhǔn)確性、降低誤差是非常重要的。

配置引起的誤差、線上混合泵失靈引起的比例誤差、放置后組成的變化。例如使用揮發(fā)性溶劑，真空脫氣引起揮發(fā)性成分的損失；流動(dòng)相吸收空氣中二氧化碳引起pH改變。流動(dòng)相組成變化對(duì)t_R值大的組分影響更大。反相溶劑微小的變化，會(huì)引起保留時(shí)間相當(dāng)大的變化。

流動(dòng)相對(duì)色譜柱進(jìn)行沖洗30min后，每隔10min~20min重復(fù)進(jìn)相同的樣品，如保留時(shí)間不變表明已平衡。應(yīng)注意，柱可能對(duì)某一組分平衡，而對(duì)其它組分尚未平衡。因此只有對(duì)所有的組分都平衡，才能正式分析樣品。